Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms