Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
MTSS1O43312 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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