Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 XCL2-201ENST00000367819 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 KRTAP4-1-201ENST00000398472 1241 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 MS4A6A-201ENST00000412309 1284 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SNPHO15079 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SNPHO15079 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SNPHO15079 KRTAP4-1-202ENST00000620667 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SNPHO15079 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SNPHO15079 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNPHO15079 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SNPHO15079 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNPHO15079 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SNPHO15079 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SNPHO15079 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SNPHO15079 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNPHO15079 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNPHO15079 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNPHO15079 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SNPHO15079 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SNPHO15079 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SNPHO15079 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNPHO15079 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNPHO15079 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SNPHO15079 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNPHO15079 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNPHO15079 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNPHO15079 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNPHO15079 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNPHO15079 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNPHO15079 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNPHO15079 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNPHO15079 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNPHO15079 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNPHO15079 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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