Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM6BO15054 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms