Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APAF1O14727 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APAF1O14727 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APAF1O14727 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APAF1O14727 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APAF1O14727 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APAF1O14727 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APAF1O14727 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APAF1O14727 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APAF1O14727 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APAF1O14727 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APAF1O14727 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APAF1O14727 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APAF1O14727 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APAF1O14727 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APAF1O14727 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APAF1O14727 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APAF1O14727 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms