Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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