Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA1C9JL84 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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