Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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CLDN25C9JDP6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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