Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM5B3KS81 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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