Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID3CA6NKF2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms