Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD8B2A6NJW9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8B2A6NJW9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms