Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms