Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms