Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TARSL2A2RTX5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TARSL2A2RTX5 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TARSL2A2RTX5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TARSL2A2RTX5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TARSL2A2RTX5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TARSL2A2RTX5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TARSL2A2RTX5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms