Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms