Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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HDGFL3Q9Y3E1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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HDGFL3Q9Y3E1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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HDGFL3Q9Y3E1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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HDGFL3Q9Y3E1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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