Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TPRKBQ9Y3C4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms