Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms