Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms