Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ84

EXO1, Exonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO1Q9UQ84 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXO1Q9UQ84 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms