Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms