Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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