Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFMBT1Q9UHJ3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms