Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms