Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms