Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD1BQ9P298 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms