Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms