Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms