Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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HOXC10Q9NYD6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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HOXC10Q9NYD6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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HOXC10Q9NYD6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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HOXC10Q9NYD6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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HOXC10Q9NYD6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HOXC10Q9NYD6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HOXC10Q9NYD6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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