Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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TDP1Q9NUW8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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TDP1Q9NUW8 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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TDP1Q9NUW8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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TDP1Q9NUW8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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TDP1Q9NUW8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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TDP1Q9NUW8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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TDP1Q9NUW8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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TDP1Q9NUW8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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