Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms