Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms