Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms