Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL1RAPQ9NPH3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL1RAPQ9NPH3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms