Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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