Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C20orf27Q9GZN8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms