Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms