Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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