Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms