Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms