Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOL4Q9BPW4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms