Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms