Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC17Q96LX7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms