Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms