Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUB2Q96DC9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms