Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms