Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms