Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms