Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms