Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms